妇产医学部生殖医学科成立于2021年2月(原北京军区总医院生殖医学科创建于2005年)，整合后的生殖医学亚专科包含解放军总医院第一、第六、第七医学中心生殖医学科。现有高职专家17名，目前开展人工授精、体外受精-胚胎移植（IVF-ET）、卵母细胞内单精子注射（ICSI）、植入前胚胎诊断技术（PGT-M、PGT-SR、PGT-A ）等，主要以治疗不孕不育症相关的多种诊疗技术，治疗范围涵盖了影响生殖健康的多种疑难疾病如：多囊卵巢综合征、排卵障碍、黄体功能不全、盆腔炎症性疾病、男性因素、免疫因素、子宫内膜异位症、子宫肌瘤、卵巢早衰、宫腔粘连及不明原因性不孕等常见类别的不孕症。是国家教委博士学位授予点、妇产科博士后流动站。其中非梗阻性无精子症患者显微取精术配合联合配偶同步促排卵、自然周期优势卵泡IVF + 小卵泡未成熟卵母细胞体外成熟技术、未成熟卵母细胞体外成熟技术等临床优势项目在国内外具影响力。在研国家级和省部级科研基金30余项，获国家级、北京市及军队成果奖10余项，获2019年军队科学技术进步奖一等奖，军队医疗成功二等奖并主持国家自然科学基金、军队中医药科研专项课题重点课题以及吴阶平医学基金等项目。

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